щенков в помете двое-малоплодие?

возможно день вязки подобран не верно.
Среднестатистически лучший период для вязки примерно на 11- 13 день течки, но может и раньше и позже. Пронаблюдайте за собакой. В какой день у нее "желание" больше всего в такой день и вязать лучше потому как именно в этот день наблюдается наибольший выброс яйцеклеток.
Еще зависит от состояния суки. У полноватых собак обычно меньше щенков либо вообще их может не быть.
И конечно же, попробуйте поменять кобеля.
Он тоже может быть причиной малого количества щенков.
З. Ы. "чем крупнее собака, тем меньше щенков" - не всегла верно!! ! По разному бывает.

Наследственно может быть. По сколько щенков её мать приносила? Но всё равно для Московской сторожевой очень мало щеночков. Можно с другим кобелем повязать. Попробуйте кормежку улучшить обоих собак еще до вязки (мясо, творог, яйца, витамины) , а в дни охоты проколоть обоим Гамавит, лучше проконсультироваться с ветеринаром.

а у кобеля от других вязок сколько было? дни правильно считали?

Радуйтесь что она не по 7 дохликов приносит. 2 щенка это нормально у такой крупной породы.

Надо поменять кобеля, за месяц до вязки пропоить АЕвит, и уточнить дни-можно сделать с помощью анализа

возможно что вязали не в самый пик овуляции, возможно у нее выходит мало яйцеклеток, а возможно у кобеля олигоспермия ( мало сперматозоидов или они малоактивные и не способные к оплодотворению) советую сменить кобеля и выяснить благоприятный день для вязки

чем крупнее собака, тем меньше щенков