У на котенку три месяца, четвертый. И тут так вышло, что появился второй кот, полтора года, некастрированный.

Кошки - животные не "стадные" и не "компанейские". Если Вы завели кошку, ей вполне хорошо и одной. Так вот устроила их природа, что они хорошо себя чувствуют поодиночке. Когда у Вас живет 1 кошка, то она считает Вашу квартиру своей территорией, и, когда появляется кто-то чужой (будь то вторая кошка, собака, да хоть слон) она чувствует себя хозяином и будет как может охранять свою территорию. Поэтому первый кот будет "наезжать" на второго. А второй защищаться и недоумевать, что он тут делает и почему. По поводу того, что он некастрированный - это отношения к делу не имеет. Даже кастрированные (и даже самочки) кошки метят территорию своим запахом. У кошек есть специальные железы возле попы по бокам и за ушами. Когда они трутся (Вы думаете, они нежатся так) - это они "смывают" незнакомый запах и оставляют чуть-чуть своего. Только этот запах едва заметен кошкам-то, не то что человеку. Поэтому Вы его даже не чувствуете, даже если сильно-сильно принюхаетесь, так что не пугайтесь и не гоняйте кошек, если они "ластятся". Они искренне рады Вас видеть, если трутся об Вас. Некастрированного кота обязательно сводите к врачу на операцию. Это нужно не только потому, что он будет "струйки" везде пускать, но и для его здоровья. Держа его некастрированным, Вы рискуете не только своим спокойным сном, но и тем, что половая система Вашего кота сведется на нет, он заболеет к старости и тогда Вам придется его так и так к врачу вести и платить уже намного больше. Я уже не говорю о том, что от длительного воздержания кот становится злой, неуправляемый, мстительный и плохо ест. Со вторым котом они рано или поздно уживутся, просто имейте терпение и все. И уделяйте обоим животным равное количетво внимания, а то 1 из них будет ревновать.

Ну во первых лучше кастрировать - тогда вероятность дружбы куда выше. Иначе возможны споры за территорию, драки и т. д.

Если кастрируете, то подружаться, но со временем.

Да ничего делать не надо! Подружатся со временем, главное, чтобы у каждого было достаточно места.