Ретушь лучше делать в самом начале обработки, или в самом конце (после тонирования и прочего)?

ВСЁ не так. Цветкор вообще надо делать в последнюю очередь т. к. ретушь иногда не то, что может изменить акценты композиции, а даже поменять всю цветовую гамму и контраст снимка. Но это для тех, кто ретачит по хардкору с роком на всю в наушниках. Вообще, ретушь - понятие растяжимое.
Раньше для меня ретушь было - это D&B, разглаживание кожи, перерисовка светотени, замена фона и прочая лабуда. Время идёт, я, к счатью, многому учусь, совершенствую вкус и сегодня для меня ретушь - это удаление прыщей и явных дефектов. Потому, что делать г0вно на фото уже не модно как бы кто-то не вопил, наглотавшись ютуба, что всё решает скил. Я скажу, что решает вкус, скилл СЪЁМКИ и чувство меры. Надеюсь, ты тоже до этого дорастёшь и поймёшь.

Ретушь лучше всего делать во все время обработки, потому что какие-то операции нужно делать сначала, какие-то потом - это касается любой обработки, в том числе и ретуши. Нужно просто понимать, как работает та или иная обработка - таблицы, в которой показано, что делают сначала а что потом, Вы не найдете - просто потому, что для обработки нужно понимание, если его нет, не будет и обработки.
К примеру, если Вы измените яркость-контрастность после подчеркивания линий, то Вам придется подчеркивать их заново, потому что это градиент яркости. Ну и дальше в том же духе.
Кстати, 90 процентов обработки и ретуши я делаю в RAW-конвертере.

Обработка в RAW конвертере - это как ОБЩАЯ ОСНОВА фотографического снимка. После этой обработки можно делать ретушь (обработку "деталей" снимка).