Откуда пошел обычай отмечать 9 и 40 дней после смерти?

Из язычества.

эти даты связаны с периодами бардо описанными в Тибетской книге мертвых.
после смерти душа в течении 49 дней обретает новое воплощение,
все эти периоды подробно описаны в Бардо Тёдол.
Если тебя эта тема очень сильно интересует - читай Тибетскую книгу мертвых!

По старому православному календарю. Неделя длилась 9 дней, месяц - 40 дней...

мнят языки по земле... к небесам, увы всуе...

Всё идёт от Православного представления жизни человека после смерти.
Три первых дня душа пребывает на земле. Следующие 6 дней она удостаивается созерцать райские обители.. .
На девятый день она отправляется в адские обители и пребывает там до 40-го дня.
На сороковой день она проходит "частный" суд и ей определяется место для пребывания до Страшного Суда.
Именно поэтому православные так сильно молятся и постятся об усопшем именно в эти сорок дней...

От реальных событий происходящих с сущностью человека (душой) в мире мёртвых: на 9-ый день эфирное тело сущности теряет связь с физической оболочкой, на 40-ой день астральное тело отключается от бренного тела и только через 1 лето (год) сущность полностью отрывается от земной оболочки и получает возможность перевоплощения.. . а Библия тут не причём совсем, и нечего ею затыкать каждую дыру в своём развитии...

В житии святого Макария Александрийского говорится, что он просил Ангела объяснить ему значение церковного поминовения усопших в 3-й день. Ангел отвечал ему: «Когда в 3-й день бывает в Церкви приношение, тогда душа умершего получает от своего Ангела облегчение в скорби, которую чувствует от разлучения с телом. В продолжение двух дней позволяется душе, вместе с находящимися при ней Ангелами ходить по земле, где хочет. Посему душа, любящая тело, скитается иногда около дома, в котором положено тело, и таким образом проводит два дня, как птица, ища себе гнездо. Добродетельная душа ходит по тем местам, где обыкновенно творила добро. В 3-й же день Господь Иисус Христос, воскресший из мертвых, повелевает в подражание Его воскресению, вознестись христианской душе на Небеса для поклонения Богу» .
Далее, по откровению Ангельскому, святой Макарий говорит, что после поклонения Богу душе бывают показаны обители святых и красоты Рая, которые душа рассматривает шесть дней, забывая скорбь, которую чувствовала, находясь в теле, и прославляя Творца. Но если душа виновата в грехах, то при виде блаженства святых она начинает скорбеть и укорять себя. По рассмотрении в течение шести дней обителей райских, на 9-й день по кончине человека душа его опять возносится Ангелами - на поклонение Богу.
Рассуждая о состоянии души в последующие дни, святой Макарий Александрийский говорит: «После вторичного поклонения души Богу на 9-й день Владыка повелевает отвести душу во ад и показать ей находящиеся там места мучения, в которых души грешников непрестанно рыдают и скрежещут зубами. По различным местам мук душа носится тридцать дней, трепеща, чтобы и самой ей не быть заключенной в них. В 40-й день она опять возносится на поклонение Господу Богу, и теперь уже Судия определяет приличное ей по делам место. Велик сей (40-й) день для почившего, ибо решает участь его до Страшного Суда Божия, а посему справедливо заповедует Святая Церковь прилежную молитву в сей день об усопшем».

Оттуда, что с 9 по 40 день душа проходит т. н. "воздушне мытарства".

обычай обычаем... да вот только посмотрите во что он превратился? Все бухают, жрут, а потом копят деньги на то чтобы побухать на 40 дней...

Что происходит на 40 день после смерти
Это время является самым трудным испытанием, так как душа должна будет не только преодолеть все препятствия на своем пути, но также и сполна отчитаться за ту жизнь, которой она жила.

Следует отметить что до наступления 40-го дня, дух не будет покидать того место где он обитал, так как у него будет своего рода шок, ведь незнание того как придется жить без физической оболочки будет пугать.
После чего на день 3-4, душа постепенно перестанет пугаться от незнания и начнет приходить в нормальное состояние, может отвязаться от своего тела и даже пройтись по окрестностям около своего дома.
При этом помните, что родственникам усопшего до 40 дней после смерти нельзя ни в коем случае громко рыдать и закатывать истерики, ведь дух все это будет слышать, испытывая вместе с тем непреодолимые мученья. Лучшее что можно сделать так, это произнести священное писание и объяснить, что дальше следует делать душе.

Читаем Древнеегипетскую Книгу Мертвых. Даты оттуда.