На чьей стороне во время второй мировой войны были мусульмане?

На стороне Аллаха наверно

Которые в СССР жили, были на стороне коммунистов, турки за немцев, остальные на нейтральной.

Ну, это ведь была не религиозная война. Так что - на разной...

Это зависело на какой стороне проживали. Европа с фашистами, СССР с коммунистами. Так как выбора не было. Некоторые с хлебом солью встречали. Некоторые нейтрально. Некоторые с оружием. Все зависело от идейных взглядов.

Смотря какие, но в основном, исламские страны были профашисткими, в некоторые даже союзникам приходилось вводить войска с целью предоствращения вступления в войну, например, в Иран и страны Палестины, Турция собиралась вторгнуться в Советский Союз после захвата немцами Сталинграда.

большенство за нашу родину

да, советские мусульмане воевали в красной армии, из недавно снесенной мечети шли колонны на фронт, мусульмане собрали денег на танковую колонну... и не на одну. так как и все боролись с фашизмом.. .
однако совсем наоборот вели себя доблестные арабы палестины... так муфтий иерусалима бывал не раз в берлине и встречался с нацистами.. .
мало того, когда танковые бригады роммеля прорывались через египет в израиль муфтий заготовил белого коня для въезда в иерусалим.. .
ну а после войны множество офицеров сс и вермахта тренировали и воевали во главе бандитских орд и армий арабских стран...

Иран объявил о своем нейтралитете. Но в действительности становился основной базой гитлеровцев на Среднем Востоке. СССР трижды предупреждало их, но Реза-шах никак не реагировал.
http://www.iraniran.ru/cgi-bin/content.pl?id=71
Битва за нефть в эпоху Второй мировой войны
Вторая мировая война зародилась на пепелищах предшествующей. Вновь Ирак стал центром притяжения для претендующих на лидерство и тех, кто отстаивал лидерство, уже достигнутое. .
А немцы нажимали, их Вермахт еще не знал поражений, на них "пахала" Европа, флот их союзников – итальянцев еще не обнаружил полной несостоятельности. Вишистская Франция выполняла роль немецкой марионетки, а ее войска контролировали Сирию и Ливан, угрожая клещами английской армии в Египте.. .
http://www.licey.net/war/book5/neft
Особенности организации и подготовки мусульманских добровольческих формирований в германских вооруженных силах
http://militera.lib.ru/research/romanko_ov/02.html
"Следует отметить, что если арабские добровольческие формирования до самого своего конца оставались в составе вермахта, то Индийский легион 8 августа 1944 г. был передан под руководство Главного оперативного управления СС. Теперь по эсэсовской номенклатуре он стал называться Индийским добровольческим легионом войск СС (Indische Freiwillige Legion der SS). В этот период легион насчитывал около 2300 человек, а его новым командиром был назначен СС-оберфюрер Г. Бертлинг (табл. 3). [104]"