Христос же сам сказал: "Не мир я вам принес, но меч! " - возможно это была метафора, но тупые христиане поняли буквально?

это была метафора, но не очень умные атеисты постоянно смешивают христианство с отступлением от христианства (крестовые походы . инквизиция )

Христос ничего не говорил. Говорили: Марк, Матфей, Лука, Иоанн.

Это не метафора.
Он этим мечом разделил жизнь на добро и зло.

...СЫН глаголил о мече духовном, а не о физическом истреблении себе подобных, но... .

Увы, отчасти ныне Вы и правы+

"наша брань не против крови и плоти, но против начальств, против властей, против мироправителей тьмы века сего, против духов злобы поднебесной. Для сего примите всеоружие Божие, дабы вы могли противостать в день злый и, все преодолев, устоять. Итак станьте, препоясав чресла ваши истиною и облекшись в броню "праведности, и обув ноги в готовность благовествовать мир; а паче всего возьмите щит веры, которым возможете угасить все раскаленные стрелы лукавого; и шлем спасения возьмите, и меч духовный, который есть Слово Божие. "(Послание к Ефесянам гл. 6, ст. 12-17)
Нашей целью в противостоянии нападкам должен быть не человек (плоть и кровь) , а тот нечистый дух, который находится в человеке и проявляется через этого человека. Божье оружие направлено против тьмы в человеке, а не против человека, сатаны оружие направлено конкретно против человека, что бы поразить человека: «Он (сатана) был человекоубийца от начала и не устоял в истине, ибо нет в нем истины. Когда говорит он ложь, говорит свое, ибо он лжец и отец лжи» (Ин. 8:44).Если мы начинаем злиться на человека, причинившего нам боль, то мы причиняя боль не только этому человеку, но сами себе, потому что "мечобоюдоострый" :" слово Божие ...острее всякого меча обоюдоострого"(Послание к Евреям гл. 4, ст. 12) и поражающий другого со злобой - поражает и сам себя (достаточно вспомнить угрызения совести, которые сразу появляются, когда ты знаешь, что поступил грубо по отношению к человеку и тем самым снова виноват перед Богом, потому что нарушил Его заповедь, и опять надо просить прощения, что бы Иисус опять очистил от того нечистого, в которое опять вляпался и Иисус очищает :"Если исповедуем грехи (проступки) наши, то Он, будучи верен и праведен, простит нам грехи (проступки) наши и очистит нас от всякой неправды. " [1 Ин 1:9] и мы ведем себя в таком случае не как духовные, направляя Слово Божье против тьмы в человеке, а как плотские, потому что наносим боль самому человеку. Если мы начинаем проповедывать что бы злоба в нем была поражена, то самому человеку боль уже не причиняется, когда я беру Слово Божье - меч духовный и говорю, что Бог сказал, что злоба не от Бога, в Боге злобы нет, то поражается тьма. Плотской человек - поражает плоть, духовный человек с помощью Слова Божьего - поражает дух, нечистый дух:
"Оружия воинствования нашего не плотские, но сильные Богом на разрушение твердынь" [2 Кор 10:4]

„меч духа, то есть слово Бога “Эф. 6:17
они много чего не поняли обдуренные, священниками

А где написано, что это метафора?

Он знал что многие прикрываясь Его именем начнут войны не уразумев что такое любить ближних

Когда им нужно себя оправдать, они всегда будут понимать буквально.
Зато если их же тексты использовать против них, они скажут, что буквально понимать нельзя.
Такая вот интересная позиция.

Матф. 26:52: „Верни свой меч на место, потому что все, кто возьмут меч, от меча и погибнут“». (Можно ли представить более вескую причину взяться за оружие, чем защита Божьего Сына? И все же этими словами Иисус показал, что его ученики не должны были прибегать к оружию.)