Как мне уберечь мою флешку от заражения вирусами?

Скорее всего на вашей флешке файловая система фат 32.
Тогда сначала вам нужно удалить файл авторан. инф, который скорее всего скрытый на флешке.

Затем создать пустой неудаляемый файл или папку с таким же названием. Чтобы вирус уже не мог запуститься на вашей флешке.

Я рассказал примерно. В видеоролике и статье, которые я вставил ниже, нормально описано, как это сделать. Я научился там. Флешка без вирусов программно

На настоящий момент самым простым способом защиты является установка бесплатной программы Panda USB Vaccine. Это «вакцина» для съемных USB-устройств, предотвращающая от ситуаций, когда файл AutoRun становится источником инфицирования. Утилита отключает этот файл таким образом, что он не может быть прочитан, модифицирован или перемещен вредоносным кодом.

http://www.pandasecurity.*com/russia/homeusers/downloads/usbvaccine/
Звёздочку * в ссылке убери!

сделай батник с текстом:

attrib -s -h -r autorun.*
del autorun.*
mkdir %~d0AUTORUN.INF
mkdir "?%~d0AUTORUN.INF.."
attrib +s +h %~d0AUTORUN.INF

далее закинь этот батник на флэшку (желательно всеже "стерильную") с системой FAT32
запусти его с флэшки, он быстренько промелькнет и создат скрытую и защищенную от изменений директорию AUTORAN.EXE
после чего 99.9% вирусов не страшны.

из личного опыта: за полтора года поймал только один висус, и тот без вреда для компа.

УСБДефендер. Проще некуда - 2 строки - защитить - снять защиту. Установки не требует - просто разархивировать и запустить.

ЕСли скидывать с флешки на другие машины, то никак, к сожалению. А если скидывать с других машин к тебе на флешку, то можно так: втыкая флешку в комп, держи нажатой клавишу ШИФТ. Флешку не открывай, а файлы на нее кидай способом "отправить" из контекстного меню. (правая кнопка).

Да ни как собстно только проверять антивирусом каждый раз

есть один способ засунуть флешку в презерватив и никогда её не вынимать
второй использовать антивирус, каждый раз поверять флешку