Имеет ли смысл держать на компе сразу две программы дефрагментации дисков, ..-просто не знаю, какая лучше -

два ставить уж точно не нужно, если уж есть желание и не жалко денег, установите Diskeeper (естественно лицензию) и вопрос о дефрагментации отпадет

Думаю первой, будет достаточно.

юзай эту прогу не пожалеешь- Raxco PerfectDisk 11.0.185 (32/64 Bit)

Raxco PerfectDisk 11 Professional - программа для дефрагментации жёсткого диска. Оптимизирует при своей работе файл подкачки, MFT таблицу, а также физическое расположение на жёстком диске файлов и директорий. Для того чтобы начать дефрагментировать какой-либо диск, нужно выбрать сам диск и нажать кнопку запуска.
При своей работе программа показывает изменяющуюся графическую таблицу, в которой в реальном времени отображается процесс дефрагментации. Данные в этой таблице отображаются в виде разноцветных квадратиков, расшифровку цвета которых можно посмотреть в главном окне программы. Стоит отметить довольно быструю работу утилиты, связанную с тем, что используется однопроходный метод дефрагментации с учётом S.M.A.R.T. данных винчестера. Может дефрагментировать не только локальные диски, но и с сетевые, причем в этом случае для облегчения настройки заданий используются профили сетевого планирования дефрагментации и полностью настраиваемое протоколирование работы. В новой десятой версии программы появились новые возможности и сделаны некоторые улучшения, а также появилась поддержка Windows 7.

Релиз одиннадцатой версии официально сертифицирован для операционной системы ерсия Windows 7. Кроме того, в этом выпуске ускорен анализ диска, усовершенствован движок для дефрагментирования, обновлен пользовательский интерфейс, добавлена поддержка для накопителей SSD, а также сделано множество других исправлений.

Raxco PerfectDisk позволяет использовать два режима:
Первый - оптимизация файлов происходит с учетом частоты обращения к ним,
Второй - без учета. Первый способ полагает перемещение часто используемых данных в самое начало диска. Кроме того, можно указывать пороговое значение текущей фрагментации, исходя из которого утилита ”решит”, производить оптимизацию или нет.

можешь и стандартной дефрагментировать и разницы не увидишь

достаточно стандартной на винде

А они не устанавливали сервисов, которые запускают дефрагментацию, когда компьютер бездействует?
2 программы могут по разному оптимизировать диски. Туда-сюда файлы в итоге будут перекидываться.