Нужно:
1. Пройти в папку "OneDrive"
%USERPROFILE%\OneDrive\ или C:\Users\имя_пользователя\OneDrive
2. Вырезать необходимые папки:
Desktop - Рабочий Стол
My Pictures - Изображения
Personal - Мои Документы
3. Вставить их в папку:
%USERPROFILE%\ или C:\Users\имя_пользователя\
4. Далее запускаем редактор реестра.
Нажимаем Win+R, в окно "Выполнить" вводим "regedit" и нажимаем ввод.
Находим путь: Компьютер\HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\User Shell Folders

Здесь вы увидите нужные нам пути, которые будут указаны через папку OneDrive. Нужно поменять их значения на те, куда вы их скопировали.
Теперь Windows будет искать эти папки по новым путям, а Яндекс.Диск, к примеру, без проблем подключит к ним синхронизацию.