Интерьер в форме греческого креста повторяет строгую простоту наружного облика собора. Своды купола украшены изображениями четырех евангелистов, а центр небесной сферы - изображением св. Людовика, протягивающего Христу меч, которым он победил неверных. Сразу под сводом купола находится Крипта с гробницей Наполеона. Можно сказать, что эта церковь - подлинная святыня, дань памяти Наполеона. Здесь также находятся гробницы членов императорской семьи и других великих людей Франции. В капелле справа - гробницы брата императора Жозефа Бонапарта и двух маршалов: Вобана и Фоша. Усыпальница другого брата императора - Жерома, находится в первой капелле слева, за ней следуют усыпальницы маршалов Тюренна и Леотейя.
Наполеон умер 5 мая 1821 года на острове св. Елены, но только по прошествии семи лет французы получили разрешение от Англии перевезти прах своего императора на землю Франции. Останки императора, как и останки египетского фараона, были замурованы в шесть гробов: первый - из жести, второй - из красного дерева, третий и четвертый - из свинца, пятый - из эбенового дерева и шестой - из дуба. Гробы были помещены в большой саркофаг из красного гранита в Крипте, специально созданной для этого знаменитым архитектором Висконти. Это возвращение во Францию было последним триумфальным маршем человека, любимого своим народом, почитаемого своими солдатами, устрашающего для своих врагов.
