Собираюсь посетить Таллин, Хельсинки и Стокгольм. В Хельсинки по-любому нужно быть с 3 по 8 апреля. Помогите с датами

Логичнее, естественно, Москва - Таллин - Стокгольм - Хельсинки - Москва.
Москва - Таллин - самолёт, поезд, что больше нравится.
Таллин - Стокгольм - паром Таллинка в 18-00. Утром на месте.
Стокгольм - Хельсинки - 3 апреля в 17-00 паром Таллинка. утром 4-го в Хельсинки.
8-го днём можно отбыть в Москву "Львом Толстым".

Ну я рекомендую 1й вариант, сначала в Таллин. Можно поездом, если время позволяет. Оттуда паромом приедете в Стокгольм. Таллинки оттуда ходят в Турку, а не в Хельсинки. Туда есть или Викинги, или Силья, расписание у них одинаковое. Я ездила Сильей. Причем, билет можно заказать по телефону, оплатить картой, и его вам пришлют на почту. На все про все 5 минут. Найдите поисковиком сайт Silja Line, там есть этот телефон. Таллинк относится к той же фирме, они объединились.
Из Хельсинки в Москву доедете поездом.

отправным пунктом можно сделать любой, все эти города прекрасно соединены транспортом. Выбирайте куда подешевле из Москвы - тот город и делайте отправным. А паромов там хренова туча.

Из Москвы до Таллина и до Хельсинки ходят поезда. Возможно, это будет дешевле самолёта.
Кроме того, Вы почему-то не рассматриваете вариант поездки паромом из Санкт-Петербурга до Хельсинки. Можете поехать к 4-ому числу паромом из Санкт-Петербурга в Хельсинки, там провести нужное Вам время, а потом паромом в Стокгольм, потом в Таллин, а оттуда поездом в Москву.