Можно ли молиться в храме Святой Софии в Стамбуле, учитывая что она была после этого мечетью, а теперь музей.

Святая София никогда не была мечетью и никогда не была музеем. Она всегда была христианским храмом, переделанным в мечеть султана-завоевателя, а затем и в музей. Потому и молится, я думаю, можно... .
Монастыри Метеора в Греции не являются музеями. Лично я туда езжу молится, но при этом там куча туристов с разных стран и разных вероисповеданий.

А турецкие правила в Аг. Софии.. . Да там и турков-то нет, одни туристы)))

Не видел там ни одного молящегося. Но запретов никаких нет, насколько я знаю. Не уверен только, насколько вообще уместно молится среди толп туристов...

Про себя - конечно, можно.

1) Не имеет совершенно никакого значения где вы молитесь.
2) Музей это не храм.

Молиться можно и, пардон за мой французский, в сортире. Каноническое правило запрещает СОВМЕСТНУЮ молитву с инославными. В конце концов, Пророк молился в православном храме, кто запретит поступить наоборот?

А вы часто в музеях молитесь? В музее - это не молитва, а так, перфоманс:)

Может, и можно, но смысл молиться в музее? Если Вас интересует церковь в Стамбуле, то в Каракее есть церковь св. Пантелеймона. На Таксиме есть греческая, в Кадыкее греческая, армянская. . Вообщем, много их там.

Молитесь - запретов нет, только падать ниц гораздо удобнее на коврах в соседней шикарной Голубой мечети.

А я видела молящихся, так что все возможно. Почему нет?

Правил нет, но ведь это уже музей, а не действующая церковь. Хотя по идее молиться можно в любом месте.