Cколькo стоит недeлю жить в Токио? Без учёт цены на caмолёт.

Это по учёбе будет поездка?

Считайте.
Гостиница стоила, в которой я жила район Cинагава (80 долл.) отель 3***, синкансены hyperdia.com, можно, как приложение, расписание и цены. По поводу JR-pass... смотрите, помогает экономить на поездах, если много ездить имеет смысл его посмотреть (не пользовалась, просто не знала, что смогу куда-то поехать из Токио). Автоматы по продаже билетов в метро не разобралась, (метро по зонам, до каждой станции билеты стоят разное количество денег), автоматы на английский дублированы не были, если вдруг купите билет дешевле, чем надо, доплатите дяде в будке на выходе (увидите, мимо не пройдете). Проездной на 1 день стоил 1590 йен. И если не понимаете, смело вылавливайте японца, они помогут (только если на работу не бегут). Если выловите полицейского доведет за руку.
Поесть. Мороженое в обычном магазине от 160 йен, поесть на улице от 170 йен, поесть в Асакусе на улице примерно от 300 до 500 йен, сеты готовой еды в маркете от 280 йен, до где-то 400 йен, есть специальные магазины готовой еды, там даже микроволновка есть, примерно 300-400 йен, в зависимости от блюда. Япония страна сладкого поэтому смело пробуйте (мочи всякие зеленый чай, сакура и т. д.). Покушать если в кафе где-то в торговом центре у меня и за 700 йен получалось, а так в среднем 1000-3000 йен, но порции огромные.
В общем. Считайте, езжайте.