Если я транзитный пассажир покупаю авиабилет самый эконом на агрегаторе или покапаю 2 отдельных а/б у 2х а/к результат?

на второй рейс все равно надо регистрироваться
если это удастся и нет багажа, то в транзитную зону
но не во всех а/п она есть
кроме того, при опоздании первого рейса второй улетит без вас
и вам никто ничего не будет должен

При прочих равных условиях лучше покупать единый билет. Тогда:
1. В начальном пункте вас зарегистрируют сразу на оба рейса, не надо будет отдельно регистрироваться на второй.
2. Багаж тоже отправят сразу до конечного пункта, не надо будет его забирать в пункте пересадки и сдавать по новой.
3. Самое главное: если вы не успеете на второй рейс по причине задержки первого, то ак будет обязана так или иначе доставить вас в конечный пункт, а при покупке раздельных билетов это будет только ваша проблема, придется покупать новый билет.

Если у вас два разных билета от двух разных авиакомпаний, не входящих в один альянс, то вам придётся пройти паспортный контроль (если мы говорим о заграничных перелётах) после первого рейса, получить багаж и идти снова на досмотр, контроль и выход на посадку.

Из вашего вопроса не понятны пункты А-В-С, откуда и куда вы летите в принципе. По РФ или из Москвы в Саудовскую Аравию с пересадкой в Лондоне.

Это не вопрос, где вы покупаете билет. А куда, с каким паспортом, визами и через что вы летите.

Вы всё правильно поняли. При двух разных билетах Вам придется выйти и снова пройти регистрацию, отстояв очередь. И если не успеете с первого рейса, то Ваша проблема. И не важно, где Вы эти билеты купили.

Лучше не морочиться и пользоваться агрегаторами Все вопросы нужно задавать представителям авиакомпании. Если нужно по дешевле найти билеты воспользуйтесь агрегаторами avia-avia.ru skyscanner.ru biletiavia.ru low-coster.ru aviasales.ru
Так же у них можно подписаться на рассылку авиабилетов по вашему направлению. Если цена на билет упадет вам на почту придет уведомление и вы решаете брать вам его или нет.