Есть хороший формат AVCHD.Подскажите пожалуйста какой программой перекодировать в этот формат BD или MKV

AVCHD дисков не быват. Диски бывают CD, DVD, BluRay и так далее.

Чтобы переконвертировать видео - изучите хотя бы пару верхних ссылок.

какой программой перекодировать ???

А зачем?? ? Почти все Blu-ray плееры проигрывают его легко и непринужденно....

Формат этот хорош только для сильных машин, не менее двухядерника.
Теперь по сабжу: да, раньше таких дисков - не было, а сейчас появились.. . на DVD пишется AVCHD
Программа для записи AVCHD ))) дисков идет комплектно к камерам Sony и называется PMB. Слышал, некоторые свежие обновления добавляют в некоторые видеоредакторы такую возможность. Но сам лично не видел.

Матрешка - это контейнер. может содержать видео разных форматов и разрешений.
BD - формат дисков.
AVCHD - формат видео.
Какова цель вообще? Надо бы конкретнее.. .

Диск DVD-AVCHD — специфический формат записи на диск DVD, предложенный Sony и Panasonic в качестве переходного формата дисков на пути к Blu-ray.

Суть формата такова: файловая система и структура диска полностью соответствует формату Blu-ray, но при этом запись производится на обычный диск DVD, таким образом мы получаем диск с видео высокой четкости, но меньшего, нежели чем на Blu-ray объема.

Обыкновенные DVD-Video-плееры такой диск прочитать не смогут, но зато его можно воспроизвести на ПК при помощи обычного DVD-ROM (Blu-ray-привод не нужен — в этом и преимущество) , а также на любом аппаратном Blu-ray-проигрывателе или с помощью игровой консоли PlayStation 3.

Объем записи на диске DVD-AVCHD — в среднем 20-25 минут.

MultiAVCHD - Просмотреть список возможностей программы MultiAVCHD (а также загрузить ее) , можно, посетив официальный сайт (там же есть ссылки и на некоторые альтернативные сайты и форумы по программе, а также на другие утилиты, созданные программистом) . Итак, как утверждает автор, его программа предназначена для тех, кто хочет:

•Объединить до 252 разных файлов (в форматах MPEG2, Quicktime MOV, MKV/AVC, AVI/AVC, M2TS/MTS, TS, TRP, M2V, VC1, 264, MP4, MPLS, IFO и др. ) или AVCHD / Blu-ray / DVD / VIDEO_TS папок в единую структуру заголовков (titles) с навигацией по меню с разрешением 1080p (1920х1080) следующих видов:
◦XMB-стиль: до 252 прокручиваемых заголовков (в стиле Sony Playstation 3 кросс-медиа-XMB)
◦"карусельное" меню: до 252 прокручиваемых заголовков
◦эскизы изображений: 36 страниц по 7 заголовков
◦список: 18 страниц по 14 заголовков
◦Возможно создание и структуры без меню (просто 252 помеченных заголовка, по которым можно переключаться во время воспроизведения)
•преобразовать свои DVD-записи без перекодирования (!) в формат Blu-ray (однако, меню DVD не импортируется)
•смотреть записи с дисков Blu-ray без перекодирования на PS3: достаточно выбрать на диске основной M2TS-файл с фильмом (самый большой по объему файл в папке BDMV\STREAM) и преобразовать его с помощью MultiAVCHD. Также в папку с фильмом можно поместить субтитры (файл с расширением .srt и именем 000XX.srt, где 000XX — имя вашего M2TS-файла) . MultiAVCHD разделит файл на части объемом не более 4 гигабайт, что позволит их записать на USB-диск (в том числе и флэш-карты)
•удалить из фильма ненужные звуковые дорожки, а также добавить новые (либо перекодированные в другой формат — например, из AAC в AC3 с меньшим битрейтом, чтобы уменьшить объем звука и всего фильма в целом)

Короче читаем тут

бррр... Дмитрий, вы просто ребус какой-то задали)
avchd - это кодек, BD-это носитель информации (как dvd,только объемнее), а mkv-это просто расширение файла. Уточните свой вопрос, какова конечная цель ваших действий?