Почему на многих ёлках не растут шишки вообще, а есть маленькие ёлочки и уже все в шишках. Это два разных вида?

это может зависить и от вида, и от условий произрастания... во-первых, разные виды ели вступают в плодоношение в разном возрасте-0дни раньше, другие позже... во-вторых, многое может зависить от условий произрастания... в отличие от многих других хвойных растений ель исключительно влаголюбива и наиболее требовательна к высокому содержанию в почве питательных веществ... на обедненных почвах или на сухих возвышенных местах при остром дефиците влаги даже и во взрослом возрасте ель может практически не плодоносить... шишек появляется мало да и те сильно повреждаются вредителями (еловой огневкой например) и осыпаются так и не доразвившись... к тому же как и среди любых организмов бывают исключения-попадаются особи, женские почки которых стерильны и плодов просто не образовывают...

Хвойных вообще много видов

Видимо, это разные виды или сорта, пора созеваня которых различается.
Это м. б. одной из причин.
Ель - однодомное, шишки созревать должны на любом растении.
Но я сама наблюдала, что плодоношение у ели происходит не каждый год.
Под окнами росли, обычно шишки новые появлялись раз в 3-5 лет, причем при этом пыльцы было столько, что ель окутывалась ею во время дождя.
Видимо, опыление происходит далеко не каждый год, а вот причина - не знаю, ищите)

В этом году вообще мало шишек и мало желудей. Как белкам жить - непонятно.

Если живёшь в мегаполисе, тебе этого не понять. Поживи лет 5 в деревне хотя бы.