Валентина Кунина
Явно не Сталина а с НКВД
Изначально -это уголовщина ...
Да нет.это конструкторские бюро под охраной
Со сталинских времён.
Этот фразеологизм образован от диалектизма " шараш",т,е, -жульё,голытьба, шваль ... Ну а контора это сообщество подобных людей...
Так и есть, всех кого туда сгоняли, были образованными людьми, но власть их считала жульем и швалью.
Ну какой же допустим Королёв -жулик?
Я так не считаю, но десятку он отсидел.
А откуда? 
В Яндекс-справке- от уголовного мира ( шараш- жульё,голытьба, шваль)
Во время войны была другая "шарашка" - авиа КБ. Там работали Туполев, Королев, и др. КБ тюремного типа.
Ох . всем бы на них равняться!
рога и копыта