Ну, для начала указали бы модель вашей мат. платы, откуда мы знаем какая она у вас?
У каждого производителя есть своя фирменная функция регулирования оборотами.
А во вторых очень может быть, что у вас установлен кулер с 3-х пиновым вентилятором, такие вентиляторы не каждая материнка может регулировать, вот и крутиться на полную катушку постоянно.
Лучшим выбором, конечно же, может быть кулер с 4-х пиновым (PWM) вентилятором и включением в BIOS функции регулировки, хотя последнее время в новых материнках она, как правило уже по умолчанию включена.
Удачи.