что лучше длинношерстная или с короткошерстная немецкая овчарка

Дело вашего личного предпочтения, кому что нравится. Сейчас длинношерстную разновидность признали и разрешили в разведение. Порода - ОДНА, но типов шерсти два: стандартная и длинная. В пометах стандартных собак рождаются щенки как с короткой шерстью, так и длинной.
На службу и спорт предпочитают брать собак со стандартной шерстью, они лучше адаптируются к погоде, менее трудоемкий уход за шерстью. Длинношерстные собаки менее популярны и у любителей. В характере различий нет, т. к. рождаются такие щенки от одних и тех же родителей, всё дело в скрытом гене, который передаётся из поколение в поколение.