на какой высоте и на какой глубине действуют границы РФ?

В высоте- почти до космоса, но не менее, чем стратосфера, а в глубине- до магмы планеты.
То есть возможное к использованию пространство, ограничиваемое по земле границами, а по воздуху и подземелью- максимальной высотой (глубиной) , необходимой и используемой для нужд государства в целом.