Есть ли в этом плохо когда человек отвечает другому повторными словами? Да-да, понял-понял, и т. п.?

В Библии повторение означает усиление и выражает сущность сказанного-его содержание.

Думаю, что ничего в этом нет намеренно плохого, хотя кого-то может и раздражать.

все люди соображают по -разному, один понимает с полу -слова, а другому нужно повторять несколько раз, это и не хорошо и не плохо