Будет ли продуктовый магазин или ларёк являться филиалом?

Магазин лучше зарегистрировать в ИФНС как обособленное подразделение.
С-но НК РФ (ст. 11, п. 2) , под обособленным подразделением подразумевается любое отделение фирмы, находящееся по адресу, отличному от юридического, где оборудованы стационарные (созданные на срок более 1 месяца) рабочие места: к примеру, торговая точка, офис, пункт выдачи заказов интернет-магазина