Имеется счетчик активной энергии трехфазный индукционный. Можно ли им измерять реактивную энергию в трехфазной сети?

Нет. Для измерения реактивной энергии по другому соединяются внутренние катушки.
На всякий случай: индукционные счётчики- запрещены к применению для коммерческих учётов.