Что будет, если оставить мочу на 1-2 года в закрытой бутылке? С точки зрения химии, но не очень занудливо.

В моче довольно много мочевины и креатинина, есть немного альбумина и сахаров. Почти всегда есть бактерия уреаплазма. Другие бактерии встречаются реже. Исходя из этого можно предположить, что бактерии будут размножаться, пока не закончатся субстраты.

...А потом влить обратно?

произойдет чудо - моча превратится в говно!