В каком случае употрибляют значение архитектура в отношение компьютера?

Смотря что имеется ввиду.

Например, архитектура материнской платы компьютера.
Каждая материнская плата спроектирована по-разному, а, следовательно, и её архитектура (логическая) - тоже.