Евгений Ильянов
Сначала эту папку в архив под пароль, потом добавишь новые файлы в корень архива они будут без пароля
Никак. Только на архив целиком. Либо архивируйте отдельно папку с паролём, а потом архивируйте всё остальное вместе с этим запароленным архивом..