почему восстание пугачева так испугало власть?

Власть привыкла к подчинению (в тексте есть) , а он отказался подчиняться, да еще и друзей с собой прихватил.

Потому что восстание достигло колоссальных размеров, в нем участвовало не только русский народ, но и башкиры, татары, казахи и др.