кто выше фсб или прокуратура по полномочием

Прокуратура это федеральный орган за соблюдением законов в стране. Они могут провести всеразличные проверки в отношении кого угодно и как угодно, включая даже ФСБ. А что касается ФСБ, то это служба которая занимается вопросами безопасности, ну а также в её компетенцию входит ОРД в отношении и даже сотрудников Прокуратуры, но при этом они должны обязательно доложить своему руководству и руководству Прокуратуры, тогда как Прокуратура имеет полное право не сообщать материалы проверок кому либо.