Можем ли принимать к вычету НДС на УСН, если сами в итоге платим НДС и выставляем счета-фактуры?

Нет. Вас оштрафуют за неправильное ведение НУ. Если выставляете с/ф, то Ваш покупатель тоже не сможет взять НДС к вычету, его тоже оштрафуют.