Можно ли, наперекор классному руководителю, садиться за любую свободную парту в классе?

А зачем делать наперекор? Возраст такой? Я бы подошла и пошепталась с классным руководителем, объяснила причину. И всем хорошо.

Зачем создавать проблему, от которой, возможно, сама и пострадаешь?

Можно только в одном случае - если "любая свободная парта" поближе к тому кто вам нравится. .