Что делать если компьютер самостоятельно переключается между программами и меняет их конфигурации или настройки?

Проверить о наличии вредных программ .Поможет Malwarebytes http://www.comss.ru/page.php?id=84

сделай откат

Какие именно программы, и какие настроики? Скорее всего это какая то программа или вирус. Нужно больше информации.

Скорее всего заражение. Проверить антивирусным сканером куреит