Если сделать обновление ПО в телефоне samsung galaxy ace2, то гарантия уберётся или нет?

ни в коем разе не уберется. Обнова оффициальная, а ставить неоффициальную прошивку (сразу андроид 4.1 который не вышел для данного аппарата) не получится. Нужен РУТ телефона, после рута телефона слетает гарантия. Так что не беспокойтесь

нет не убереться это же просто обновление, и тебе оно ничем не обезуемое так что ставь смело и не бойся!