можно не пускать в квартиру человека не собственника, но прописанного в ней?

нет потому что это может быть мошенник который подкупил тех кто записывают кто где живёт: )

Нет конечно, с какой стати

Нет

с какого перепуга, если зарегистрирован, значит имеет право жить

Если человек зарегистрирован, то имеет полное право жить в этой квартире. Снять его с регистрационного учета можно только через суд. если туда обратится собственник.