Как оформить приказ?

Ситуация следующая, сотрудник работает с 27.09.2011 года, в январе 2012 берет без содержания в счет ежегодного трудого отпуска 12 дней, с 12.03 по 17.04.2012 пишет вновь заявление без содержание с счет отпуска (оговорочка у данного сотрудника отпуск 36 дней) , но во время отпуска без содержание выходит на работу не на полный рабочий день так, как учиться (ее табилируют по факту отработанных часов, но в то же время она числиться в отпуске без содержания) , и всего получается за это время ее не было всего 4 дня. Сейчас сотрудник хочет взять трудовой отпуск в котором мы не можем ей отказать, так как он положен и выплатим отпускные в полном объеме, но по идеи она же должна отдыхать всего 20 дней. Так а если это та то как оформить приказ на то, что отпуск предоставлен, но в то же время по дням она выходит раньше?

Она брала в счет отпуска или за свой счет? (это разные вещи)

Те дни которые она работала вы не должны учитывать в отпуске, должен был быть перерасчет

нет в ТК РФ такого понятия "в счет очередного отпуска".
если вы предоставляли работнику часть очередного отпуска значит обязаны были его сразу и оплатить. если вы предоставляли работнику отпуск без сохранения заработной платы, значит вы ни как теперь очередной отпуск на эти дни не уменьшите. положено 36 к. д. , значит обязаны предоставить 36 к. д. и раньше она выходить не обязана. на каком основании-то? заставить работника выйти на работу во время отпуска вы не можете, отозвать из отпуска без её согласия тоже нельзя.

Вы определитесь, или работник у вас был в очередном отпуске, или за свой счет.
И как во время отпуска можно выйти на работу? Как вы это отразили в табеле?