! загрузиться с LiveCD и проверить на вирусы!
0. не держать файлов и т. п на Рабочем столе!
1. сохранять настройки Рабочего стола через DesktopOK
2. отсутствие галочки напротив пункта «Отображать значки рабочего стола» в подменю «Упорядочить значки» контекстного меню вызываемого при щелчке правой кнопкой мыши на пустом месте рабочего стола. Пустое место на вашем десктопе сейчас найти будет не трудно, вызовите это меню, перейдите в подменю «Упорядочить значки» и проверьте стоит ли птичка возле «Отображать значки рабочего стола»
3. Возможно это и очевидно, но тем не менее часто пропавшие ярлыки находятся в папке «Неиспользуемые ярлыки» , а файлы и папки с рабочего стола могут случайно попасть в корзину.
Папка «Неиспользуемые ярлыки» может находится на вашем рабочем столе если механизм по удалению неиспользуемых ярлыков Windows был хоть раз задействован и им были обнаружены ярлыки к которым не обращались 60 и более дней. Он также может отрабатывать автоматически если стоит галочка «Свойства экрана -> Рабочий стол -> Настройка рабочего стола -> Выполнять очистку рабочего стола каждые 60 дней» .
Чтоб вернуть файлы из этой папки, просто зайдите в неё и перенесите файлы назад на рабочий стол.
Тоже самое с корзиной — зайдите в неё и проверьте нет ли там ваших файлов и если они там, то восстановите ваши пропавшие с рабочего стола ярлыки, файлы и папки.
4. Если всё вышеизложенное не помогло восстановить значки, файлы и папки с вашего рабочего стола, то велика вероятность что файлы действительно были удалены — прямо с рабочего стола с зажатой клавишей Shift, из командной строки, с помощью вашего файлового менеджера настроенного удалять файлы мимо корзины (например, FAR-а) или в результате вирусной атаки.
⇢ 
