Если в коде на C есть форк, его можно скомпилить под винду?

Нет, но можно его убрать
//...
#if (defined(linux) || defined(__linux) || defined(__linux__) || defined(__GNU__) || defined(__GLIBC__)) && !defined(_CRAYC)
//форк
#endif
//...

Т е под linux программа будет компилится с форком, а под windows без