Какая разница между методом и инструментом если она есть вообще?

Метод - набор инструкций и алгоритмов объединенных в логически целостный объект для решения поставленной задачи.
Инструмент - материальный или информационный элемент непосредственно применяемый при решение поставленной задачи.

Метод может быть одним из инструментов, а инструмент служит для реализации метода