Как повернуть видео (на 90 градусов) , и можно ли это сделать с помощью программы VirtualDub (если да, то как?)?

У вас в новом файле при проигрывании черный экран (в проигрывателе) и без звука? Возможно в проигрывателе отсутствует кодек для открытия.
VirualDub работает с кодеками установленными в систему. Установите бесплатный XviD и проблем не будет с видео и со звуком. Кодек XviD и проигрыватель Media Player Classic Home Cinema (MPC-HC), он поддерживает все распространенные видео и аудио форматы файлов, доступных для воспроизведения.
Можете установить в версии Standard от K-Lite Codec Pack. Как открыть видео в VirtualDub и как правильно установить K-Lite Codec и настроить MPC-HC https://sites.google.com/site/schastevmire/kak-otkryt-video-v-virtualdub

Давайте по порядку. Я создавал сайт по программе, чтобы вопросов было как можно меньше и было всё как можно проще.
Как перевернуть видео
Фильтр Rotate2 Этот фильтр представляет более широкие возможности поворота картинки, здесь угол поворота, вы вписываете сами. И если после поворота видео вам надо обрезать края изображения, то вам нужен фильтр. . читать далее https://sites.google.com/site/schastevmire/vsego-ponemnogu
Кодирование в Virtualdub, кодеком XviD в один и два прохода - видео на главной странице https://sites.google.com/site/schastevmire/home
Всё что я упоминал в видеоуроках вы можете найти на странице https://sites.google.com/site/schastevmire/ssylki Отсюда и качаем программу, русифицированную, без установки в систему.

Есть и отдельная программа для поворота Free Video Flip and Rotate http://www.dvdvideosoft.com/ru/products/dvd/Free-Video-Flip-and-Rotate.htm

AVS Video Editor - полнофункциональный видео редактор для создания профессионального видео и процессинга
http://badab.ru/load/multimedia/avs_video_editor_6_5_1_246_paket_dop_ehffektov/4-1-0-99
Как скачать с файлообменника не отправляя смс
http://issson.ru/forum/7-66-1