если мне позвонят из спб с мобильного мтс на билайн москва. снимут ли с меня деньги?

Не снимут, если только Вы в Москве не находитесь в роуминге. То есть Ваш номер билайна к Москве относится

обязательно... .
это два разных сот. оператора и вы в роуминге из-за регионального тарифа....