валютное нарушение контракта

ну если в багке при открытии паспорта сделки к вам не было претензий - то ничего срашного нет.
В любом случае можно подписать Доп соглашение к Договору - где будут четко прописаны даты оплат - и уже "подогнать" их пол реальное поступление денег.

в том то и дело, что у вас не написано с момента чего наступает 5 дней. Если банк у вас пропустил такой контракт то Вам нечего опасаться, потому что в первую очередь - это коснется банка.
в контрактах в первую очередь смотрят на пункт возврата денег в случае неиполнения какой либо стороной обязательств. Операция совершилась, закройте паспорт сделки и сидите себе спокойно, декларация тоже закрыта, нет оснований для преживаний.
у нас было хуже, у нас не возвращала россия предоплату и не отгружала продукцию, причем просрочка возврата средств была 90 дней, пришлось искать лазейку в законе.

Я тоже думаю, что проблем не должно быть. На таможне при получении и растаможке будут смотреть, что в контракте есть требование о предоплате, что оно отражено в листе 2 паспорта сделки, что предоплата была произведена. А сроки оплаты и поставки важнее для Вас и Вашего контрагента.
И видимо у вас 100% предоплата, 30% ведь тоже до отгрузки платите?

проблем быть не должно, если банк пропустил, т. к. и в РФ и РК банковский валютный контроль как раз этим и занимаеться, что бы не было проблем с законом. Паспорт открыли значит все нормально.

В своей практике столкнулся, с тем что налоговая стала камералить на предмет соблюдения валютного законодательства в рамках валютного контроля.
На всякий случай посоветовал бы оформить дополнительное соглашению к контракту.