Подскажите предоставляется ли стандартный налоговый вычет работнику за те месяцы когда у него не было дохода?

нет конечно

Письмо Минфина России от 19.08.2008 N 03-04-06-01/254
В Письме указано, что если в отдельные месяцы налогового периода дохода не было, то вычеты предоставляются за каждый месяц налогового периода, включая и те, в которых не было выплат дохода.
Аналогичные выводы содержит:
Статья: Физическое лицо не является резидентом РФ ("Горячая линия бухгалтера", 2008, N 14)
Консультация эксперта, 2008

Письмо Минфина России от 14.08.2008 N 03-04-06-01/251
Финансовое ведомство рассмотрело следующую ситуацию: работник находился в отпуске за свой счет, в результате чего сформировалась сумма неиспользованного стандартного вычета по НДФЛ. По мнению Минфина, если сумма вычетов превысит размер выплачиваемого дохода, то разница между этими суммами переносится на следующие месяцы этого налогового периода.

Письмо Минфина России от 06.05.2008 N 03-04-06-01/118
Финансовое ведомство разъяснило, что если в отдельные месяцы у налогоплательщика вообще не было доходов, то стандартные налоговые вычеты накапливаются с начала налогового периода. Поэтому сотруднице, которая с января по апрель находилась в отпуске по уходу за ребенком и вышла из отпуска без сохранения содержания, стандартный вычет предоставляется за каждый месяц налогового периода начиная с января.
Аналогичные выводы содержит:
Обзор: Новые документы для бухгалтера. Выпуск от 28.05.2008

Предоставляются конечно.
Вычет предоставляется на календарный год - какая разница - есть доход или нет?

Предоставляются если до этого доход не превысил 40000 рублей.

Предоставляются