Почему ЕСН, НДС, акцизы и др. федеральные налоги относятся именно к федеральным налогам?

Всё наоборот.
Сначала определяют за что можно взимать налоги и для чего, как удобно тратить эти суммы налогов, а потом уже их называют - НДС и т. д. , а не существует НДС и решили сделать его федеральным.

Согласно п. 1 ст. 12 Налогового Кодекса Российской Федерации (НК РФ) в Российской Федерации устанавливаются следующие виды налогов и сборов: федеральные, региональные и местные.
Пункт 2 статьи 12 НК РФ опрелеляет, что Федеральными налогами и сборами признаются налоги и сборы, которые установлены настоящим Кодексом и обязательны к уплате на всей территории Российской Федерации, если иное не предусмотрено пунктом 7 статьи 12 НК РФ.
Пункт 3 статьи 12 НК РФ Региональными налогами признаются налоги, которые установлены настоящим Кодексом и законами субъектов Российской Федерации о налогах и обязательны к уплате на территориях соответствующих субъектов Российской Федерации, если иное не предусмотрено пунктом 7 настоящей статьи.
Региональные налоги вводятся в действие и прекращают действовать на территориях субъектов Российской Федерации в соответствии с настоящим Кодексом и законами субъектов Российской Федерации о налогах.
Пункт 4 статьи 12 Местными налогами признаются налоги, которые установлены настоящим Кодексом и нормативными правовыми актами представительных органов муниципальных образований о налогах и обязательны к уплате на территориях соответствующих муниципальных образований, если иное не предусмотрено настоящим пунктом и пунктом 7 настоящей статьи.
Местные налоги вводятся в действие и прекращают действовать на территориях муниципальных образований в соответствии с настоящим Кодексом и нормативными правовыми актами представительных органов муниципальных образований о налогах.

Так определено Налоговым кодексом РФ. Это закон