Что лучше оформить взнос от учредителя как финансовая помощь или займ?

Займ возвращается, с учредителем решайте, дарит он деньги или дает на время. Договор нужен в любом случае.

Конечно займ.

Финансовая помощь. Передача средств или имущества в данном случае не предполагает их возврата когда-либо. Внести средства по такому договору можно либо наличными деньгами в кассу организации, либо перечислить их в безналичном порядке на банковский счет компании. В случае оказания безвозмездной финансовой помощи не происходит ни увеличение УК, ни официальный перерасчет долей акционеров, учредителей.
Должно быть Решения учредителя, поскольку он является единственным участником ООО. А если директор и учредитель одно лицо, то Договор вообще глупо заключать. Решения вполне достаточно.
В случае если финансовую помощь оказывает учредитель, доля участия которого составляет более 50 % , такие средства не включаются в доходы компании и не облагаются налогом на прибыль (ст. 251, п. 1 п. п. 11 НК РФ) . А также НДС – ст. 143 и 146 НК РФ. В отношении безвозмездной передачи имущества существует ограничение – оно не признается доходом (то есть не облагается налогами) только в том случае, если в течение одного года с момента его получения указанное имущество (за исключением денежных средств) не передается третьим лицам.
В случае если помощь оказывается участником-владельцем 50 % и менее акций компании – в отношении безвозмездно полученных доходов для организации применяется статья 250, п. 8 НК РФ, компания должна будет исчислить и уплатить налог на прибыль, а при применении УСН - включить полученные средства или имущество в доходы.

Заем надежнее. Вдруг хорошо поработаете, захотите снять деньги с расчетного счета без налогов, оформите возврат займа. А если вообще возвращать не захотите, в любое время можете вернуть заем и снова внести деньги как финансовую помощь.

а еще нужно учитывать если займ процентный или беспроцентный. Это то же не легкий и проблемный вопрос. Есть свои особенности.

Лучше займ - всегда вернуть можно.
И налоги никакие не возникают.