Как оформить договор займа, если директор сам предоставляет займ и является одним из учредителей?

Уточните! Кому займ? Фирме или работнику?
http://www.llex.ru/glava_3._zaem_ot_uchredi

Обычный договор займа, где он является и заимодавцем и заемщиком, только подпись заемщика пусть ставит какое-то другое лицо; так же пропишите проценты по займу (выше, чем ставка рефинансирования ЦБРФ) , тогда может налорги и поверят. А с разницы ставки ваш директор и учредитель должен будет заплатить НДФЛ.

Обычный договор между физ. лицом и ООО, можно оформить как беспроцентный займ с определенным или не определенным сроком ( в инете полно можно скачать) . Ваш директор идет в банк перечисляет деньги на р/с вашего предприятия, а потом так же обратно снимает их.

Кто кому займ дает? Если директор фирме, то не важно, учредитель он или нет. Оформляете договором займа. Имейте в виду, если беспроцентный, посчитайте свою выгоду и снее налог.
Ну, а если директор-сотруднику, то физлицо физлицу.

В банк идти не обязательно, если получили займ в кассу - то делайте с ним что хотите, сдавать ДС на расчетный счет или нет - это Ваше право

Вы не пишете на каком режиме работает предприятие - на общем или на УСНО. http://www.glavbuh.net/forum/index.php/topic,473 - прочитайте, все очень подробно описано для предприятия на УСНО. Никакого НДФЛ не удерживаете. Д50 (51) К66 - получен займ (это без %), Д66 К 50 (51) - возвращен займ заимодавцу. Вот и всё. Для общего режима - аналогично. В доход эта сумма не включается.