Почему своей машины, за которую я заплатила несколько своих зарплат с вычетом налога на доход должна его платить заново?

Вы купили машину за 100 рублей, с которых уплатили налоги до момента покупки. Через 3 года вы ее продаете за 120 рублей. И заметьте уплатить налоги вы должны с 20 рублей, а не с 120, при условии, конечно, что в договоре покупку машины (в первом, когда вы покупали) стоит сумма 100 рублей, а не 1 рубль. Где тут несправедливость? А если вы идете навстесу покупателю и занижаете сумму продажи авто - ну, тут уж вам ничем не помочь - ни одно доброе дело не остается безнаказанным.
И еще - если машина в собственности более 3 лет (а в вашем вопросе именно так) налог не платится.

А если авто был в вашей собственности больше трех лет, то и налог платить не надо. А если меньше - то вам дается налоговый вычет (250 000 руб. ) и кто вам мешает написать в справке-счете сумму продажи 250 тыс. руб. и не платить НДФЛ с дохода от продажи.

как то странно, налог только с продажи платиться вроде как а при покупке ничего платить не надо вроде

Потому что мы живем в такой стране, в которой чиновники и "слуги народа"непрестанно думают, как с овец содрать не одну шкуру а восемь ((((((((((

С вашей зарплаты снимали 13 % налог с дохода, причем тут машина, хоть квартира. А когда продаете вы с ее продажи должны заплатить. Если докажете, что продали дешевле ничего платить не будете.