Взаимозачет. Как быть с НДС?

1. Зависит от системы налогообложения Вашей организации
2. НДС'ом облагаются все работы и услуги, оказанные на территории РФ. Не зависимо от способа расчета за них.
Подробнее можно проконсультироваться на форуме сайта klerk точка ru

А, причём здесь НДС. Если бы оплатили услуги по хранению, а Вам бы заплатили за товары что деньги нужно было НДС обложить )

До 2009 года НДС при взаимозачете нужно было оплачивать отдельным платежным поручением. Теперь этого делать не надо. Если вы и ваш контрагент работаете с НДС, то зачитываете НДС в общем порядке.

Взаимозачет оформляется актом, который с этого момента считается первичным расчетным документом. Акт подписывается представителями сторон и заверяется печатями организаций. В акте взаимозачета нужно подробно отразить состав возникшей задолженности. Стороны должны указать сумму обязательств друг перед другом отдельно по каждой операции, проведенной ранее. Суммарная величина задолженности должна фигурировать в акте как итог, но не подменять собой детальной расшифровки долга. Задолженность сторон, отраженная в акте, должна сопровождаться ссылками на подтверждающие документы: договоры, накладные, счета-фактуры, акты выполненных работ, платежные документы. В акте взаимозачета следует отдельно выделять сумму НДС, относящегося к каждому обязательству. Задолженности сторон на момент проведения взаимозачета обычно не совпадают. Соответственно будут различаться и суммы НДС, предъявленные сторонами друг другу. При проведении взаимозачета встречная задолженность гасится на сумму наименьшего требования. Поэтому участники взаимозачета могут принять к вычету только ту часть «входного» НДС, которая относится к зачтенной сумме долга.
Если величина задолженности организации перед своим контрагентом совпадает с суммой, на которую проводится взаимозачет, проблем не возникает: сумма «входного» НДС принимается к вычету полностью. Если же при взаимозачете погашается лишь часть задолженности организации перед контрагентом, «входной» налог принимается к вычету не полностью.

Если Ваша организация работает с НДС, и организация по взаимозачету работает с НДС, то и суммы взаимозачета содержат равные НДС, которые компенсирую труг-друга. Но эти суммы НАДО ОТОБРАЖАТЬ в Книгах (покупок и продаж) , и сч-фактуры делать к Акту взаимозачета. Для каждой из сторон суммы по взаимозачету являются реализацией, соответственно и НДС начисляется и зачитывается как при обычной деятельности. Просто в итоге он равен (взаимозачет) , и платить нечего :-)