Нужна помощь по аудиту!!!!

Аудитор ИМЕЕТ ПРАВО оказывать несколько видов услуг одному и тому же клиенту (даже одновременно) , за исключением описанной выше ситуации, когда проведению аудита предшествовали услуги по ведению и восстановлению бухгалтерского учета. В Вашем случае помощь при переходе на компьютеризованную форму учета следует рассматривать скорее как консалтинговые услуги и оказание таких услуг НЕ ВЛИЯЕТ на независимость аудитора при условии, что он не выходит за рамки консалтинга, т. е. не влияет на принятие решений руководством.

Согласно 307 ФЗ Аудит не может осуществляться:
аудиторскими организациями, индивидуальными аудиторами, оказывавшими в течение трех лет, непосредственно предшествовавших проведению аудита, услуги по восстановлению и ведению бухгалтерского учета, а также по составлению бухгалтерской (финансовой) отчетности физическим и юридическим лицам, в отношении этих лиц;
В вашем же примере ситуация обратная, сначала аудит проводили, потом автоматизируют учет.
Так же согласно закону об аудиторской деятельности
Аудиторские организации, индивидуальные аудиторы не вправе осуществлять действия, влекущие возникновение конфликта интересов или создающие угрозу возникновения такого конфликта. Для целей настоящего Федерального закона под конфликтом интересов понимается ситуация, при которой заинтересованность аудиторской организации, индивидуального аудитора может повлиять на мнение такой аудиторской организации, индивидуального аудитора о достоверности бухгалтерской (финансовой) отчетности аудируемого лица. Случаи возникновения у аудиторской организации, индивидуального аудитора заинтересованности, которая приводит или может привести к конфликту интересов, а также меры по предотвращению или урегулированию конфликта интересов устанавливаются кодексом профессиональной этики аудиторов.
В реальности конечно окажет данная услуга влияние на мнение аудитора.