Чем грозит показывание убытков в Упрощенке?

конечно придет, может выручку мониторить. А вообше убытки по итогам вторго и последующих финансовых годов- это повод налоговой для подачи на ликвидацию предприятия

вы не сдаете бухгалтерских баланс ( а вот с 2013 года будем вести бухучет и в УСН и сдавать отчетность) , поэтому налоговой безразличны ваши убытки или прибыль, самое главное какое у вас налогообложение : если от доходов 6%, то просмотрят чтобы вы все показали доходы, а если доходы минус расходы:
то здесь посложнее, налоговая будет смотреть особенно ваши расходы, соответствуют ли они тому что они должны учитываться в расходах
и вообще у вас не может быть убытков так как в УСН доходы и расходы учитываются кассовым методом:
Статья 346.17. Порядок признания доходов и расходов
1. В целях настоящей главы датой получения доходов признается день поступления денежных средств на счета в банках и (или) в кассу, получения иного имущества (работ, услуг) и (или) имущественных прав, а также погашения задолженности (оплаты) налогоплательщику иным способом (кассовый метод)... .
2. Расходами налогоплательщика признаются затраты после их фактической оплаты.

налоговая начнет с проверки, а может закончить закрытием компании

если налогообложение: доход-расход, то очень даже могут быть убытки. В этом случае заплатите минимальный налог.
Налоговой инспекции не очень то интересно выходить на проверку к убыточному предприятию, в надежде (в расчете) на то, чтобы перекрыть ваши убытки и доначислить довольно крупную сумму.
Просто чередуйте (по годам) min налог и с минимальной прибылью

да возьмите и не принимайте половину расходов к налоговому учету

Сегодня 2017 год, звонок из налоговой, что у нашей организации был убыток 2011 году указанный по декларации! Ничего не пойму, так как сменился бухгалтер. Почему налоговая только сейчас об этом сообщает?