Надо ли регистрировать счета-фактуры на авансы, зачтенные в течение 5-ти календарных дней?

Согласно п. 3 ст. 168 Налогового кодекса РФ при получении сумм оплаты, частичной оплаты в счет предстоящих поставок товаров (выполнения работ, оказания услуг) , передачи имущественных прав выставляются соответствующие счета-фактуры не позднее пяти календарных дней, считая со дня получения сумм оплаты, частичной оплаты.
Президиум ВАС РФ указал, что если предварительная оплата и отгрузка приходятся на один налоговый период, то аванса для целей НК РФ не возникает (Постановления Президиума ВАС РФ от 10.03.2009 N 10022/08, от 27.02.2006 N 10927/05). А значит, выставлять счет-фактуру на полученную предоплату не нужно (Постановления ФАС Московского округа от 23.04.2010 N КА-А40/3908-10, ФАС Северо-Кавказского округа от 24.09.2010 N А53-29476/2009, Пятнадцатого арбитражного апелляционного суда от 28.03.2011 N 15АП-1864/2011).
Однако контролирующие органы придерживаются иной позиции. Налоговая служба настаивает на том, что при получении оплаты (частичной оплаты) в счет предстоящей поставки счет-фактура должен быть выставлен, даже если отгрузка приходится на эти же 5 дней в том же налоговом периоде (Письмо ФНС России от 10.03.2011 N КЕ-4-3/3790). Мнение налоговой службы фактически поддержал ФАС Поволжского округа, указав на то, что полученная оплата (предоплата) в счет предстоящих поставок подлежит включению в налоговую базу (Постановление ФАС Поволжского округа от 26.01.2010 N А55-6564/2009).
При этом Минфин России в своих разъяснениях указывает на то, что выставлять счет-фактуру на сумму полученной предварительной оплаты не надо, только если в течение пяти дней после получения оплаты происходит отгрузка товара (п. 1 Письма Минфина России от 06.03.2009 N 03-07-15/39).
Таким образом, во избежание споров с налоговыми органами счет-фактуру на сумму полученной оплаты (частичной оплаты) , по нашему мнению, целесообразнее выставлять.

Нет не надо.