Счет-фактура на аванс

для себя вы оформляете счф на все авансы (что было всегда)
С 01.01.09 в люди отдаете только счф на авансы по заключенным договорам, в которых есть пункт об авансовых платежах, или по счетам (что тоже является офертой) , в которых четко прописано, что это аванс

С 1 января 2009 г. вы обязаны выставлять покупателям счета-фактуры не только при реализации (после отгрузки) товаров (работ, услуг, имущественных прав) , но и при получении полной или частичной предоплаты в счет предстоящих поставок (абз. 2 п. 1, абз. 1 п. 3 ст. 168 НК РФ) . Это связано с тем, что теперь покупатели вправе принимать к вычету суммы уплаченных авансов до фактической реализации (п. 12 ст. 171 НК РФ) . А для подтверждения права на вычет им нужны счета-фактуры (п. 9 ст. 172 НК РФ) .
Соответствующие дополнения внесены в Налоговый кодекс РФ Федеральным законом от 26.11.2008 N 224-ФЗ (п. 5 ст. 2, п. п. 1, 11 ст. 9).

Так что Вы обязаны выдавать счет-фактуру на аванс всем организациям, внесшим вам аванс.

на аванс только счет (не фактура) без акта, НДС не отображаете

Нужно сначала заключить договор, а потом уже решать всякие "бумажные дела". А счет-фактуру нужно выписывать не позднее 5 дней после оплаты, даже если договоа нет.

Новое веяние в МФ - счет-фактуру на аванс, если отгрузка произошла в течение 5 дней, выдавать не надо, а во всех остальных случаях - обязательно.

с 1 января 2009 г. счет фактура на аванс выдается всем организациям

На ЛЮБОЙ аванс!